酶標分析儀的功能是用來讀取酶聯免疫試劑盒的反應結果，因此要得到準確結果，試劑盒的使用必須規范。 許多醫院在使用酶標儀之前是通過目測判斷結果，操作過程隨意性較大，在使用酶標儀后如果不能及時糾正操作習慣，會造成較大誤差。在酶標分析儀的操作中應注意以下事項：
1、使用加液器加液，加液頭不能混用。
2、洗板要洗干凈。如果條件允許，使用洗板機洗板，避免交叉污染。
3、嚴格按照試劑盒的說明書操作，反應時間準確。
4、在測量過程中，請勿碰酶標板，以防酶標板傳送時擠傷操作人員的手。
5、請勿將樣品或試劑灑到儀器表面或內部，操作完成后請洗手。
6、如果使用的樣品或試劑具有污染性、毒性和生物學危害，請嚴格按照試劑盒的操作說明，以防對操作人員造成損害。
7、如果儀器接觸過污染性或傳染性物品，請進行清洗和消毒。
8、不要在測量過程中關閉電源。
9、對于因試劑盒問題造成的測量結果的偏差，應根據實際情況及時修改參數，以達到效果。
10、使用后蓋好防塵罩。
11、出現技術故障時應及時與廠家聯系，切勿擅自拆卸。
酶標分析儀廣泛地應用在臨床檢驗、生物學研究、農業科學、食品和環境科學中，例如低紫外區的DNA、RNA定量及純度分析(A260/A280)和蛋白定量，酶活、酶動力學檢測，酶聯免疫測定(ELISAs)，細胞增殖與毒性分析，細胞凋亡檢測(MTT)，報告基因檢測及G蛋白偶聯受體分析(GPCR)等。
特別在近幾年中，由于大量的酶聯免疫檢測試劑盒的應用，使得酶標儀在生殖保健領域中應用越來越廣泛，同時促進了生殖健康技術水平提高。
